Un subdominio sigue siendo parte del dominio que apunta a unos DNS… que alguien me corriga pero no podes tener un dominio.com en un servidor y otro.dominio.com en otro servidor.
Hola @hecktoras , esto es posible. Por lo que entiendo en tu subdominio vas a tener otra aplicación o archivos distintos a lo que tenés en el dominio, no?
Si ese es el caso, tendrías que apuntar el registro A del subdominio a la IP del servidor donde tendrías alojado el subdominio y con eso debería ser suficiente. Cualquier cosa avisame.